芸予諸島北東部に位置し、本州尾道から約17km南に位置する。島の北東側は布刈瀬戸を挟んで向島、南西側が生口水道を挟んで生口島となり、それぞれ因島大橋・生口橋で結ばれしまなみ海道を構成する。東側は横島、北西側
芸予諸島北東部に位置し、本州尾道から約17km南に位置する。島の北東側は布刈瀬戸を挟んで向島、南西側が生口水道を挟んで生口島となり、それぞれ因島大橋・生口橋で結ばれしまなみ海道を構成する。東側は横島、北西側が細島・小細島・佐木島で、すべて広島県。南側が長崎瀬戸を挟んで愛媛県上島諸島(弓削島・生名島・岩城島)にあたる。
面積35.03km2(2014年10月時点)。地質はほぼ花崗岩。気候は瀬戸内海式気候。最高峰は奥山(セブアノ語版)390m。平地が少なく、山および丘陵地で構成されており、中央付近を斜めに横切る国道317号によって奥山系と青影山系の2つの山系で二分される。現在の平地の多くは古来は入江で近世からの塩田あるいは新田開発により土地が形成された。
因島は旧因島市域の中心であったが、市町村合併により現在は尾道市となった。島の中心は南西の土生町である。その西側対岸の生口島に因島洲江町・因島原町とあるが、これは旧因島市域であったことによるものである。
島の北側は”安芸地乗り”と呼ばれた古くからの瀬戸内海の主要航路であった。これは四国と大島の海峡である来島海峡が瀬戸内海有数の海の難所であったため、そこを避けるようにこの島近辺に航路ができたことによるもので、中世においては村上海賊(村上水軍)の拠点として、近世は廻船操業、近代以降は造船業と、船で栄えた島である。平地が極端に狭かったことから稲作は近代に入るまでほぼ行われておらず、古くは製塩が盛んであり、近代以降は丘陵地と温暖な気候を活かした商品作物、花や柑橘類の栽培が行われている。棋聖本因坊秀策が生まれた地であり、囲碁の島としても知られる。旧因島市はこの周辺の島嶼部において唯一市制施行したものであり、この島はインフラストラクチャーが充実し、周辺島々の中核を担っていた。